枸杞果实的农药残留来源于人为地施用化学农药。当害虫对枸杞植株的为害达到人为不可控制时，被迫使用化学农药来防治，这叫被动防治。如果在掌握各种害虫的生育规律和栖息地后，及时采取春秋季清理园地、泼茨（中宁灭蚜的方法之一）、中耕、灌水、翻园等农业防治法可大大减少害虫的虫口密度，减少化学农药的使用次数和使用量，这叫主动防治。宁夏枸杞研究所曾在防治枸杞瘿蚊这一害虫上做过研究。瘿蚊是蛀果型害虫，成虫在土内越冬并羽化，4月下旬枸杞现蕾期上树为害花蕾，喷洒高毒的内吸剂农药，防治效果仅40%左右，危害严重者一次性花蕾损失率高达70%。经连续2年观察，成虫出蛰时间在4月24日左右，采取灌水后不中耕的办法（灌大水不排水、不中耕，形成土层表面板结）将瘿蚊的成虫淹死、闷死在土内，有效地控制了瘿蚊的虫口密度。此方法在芦花台园林场推广近10年，没有发生瘿蚊的大发生为害。
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