在茄子苗期，有些病害严重影响出苗或幼苗的正常生长，如猝倒病、立枯病、炭疽病、灰霉病、绵疫病等；因此，育苗期、幼苗期是防治病虫草害、培育壮苗、保证生产的一个重要时期。
对于育苗田，可以结合平整土地，进行土壤药剂处理。选择药剂时要针对本地情况，科学地选用药剂及处理方法。
苗床用福尔马林消毒，在播种2周前进行，每平方米用30ml福尔马林，加水2～4kg，喷浇在床土上，用塑料膜覆盖4～5天，除去覆盖物，耙平土地，放气2周后播种；或用70%五氯硝基苯可湿性粉剂与50%福美双可湿性粉剂1:1混合，每平方米施药8g，或用25%甲霜灵可湿性粉剂4+5kg，待苗床平整、浇水后，将1/3的药土撒于地表，播种后再把剩余的药土覆盖在种子上面。线虫病的田块，每平方米可用1.8%阿维菌素乳油1m1，稀释2000～3000倍液，用喷雾器喷雾，然后用钉杷混土；也可用5%丁硫克百威颗粒剂5～7kg/亩、35%威百亩水剂4～6kg/亩、5%毒死蜱颗粒剂3kg/亩或10%噻唑膦颗粒剂1.5～2kg/亩处理土壤。可与上述杀菌剂一同施用。
种子处理，可用种子重量的0.4%的70%甲基硫菌灵可湿性粉剂+0.4%的25%甲霜灵可湿性粉剂+0.3%的50%福美双可湿性粉剂拌种，或50%多菌灵可湿性粉剂800倍液+25%甲霜灵可湿性粉剂800倍液+50%福美双可湿性粉剂800倍液浸种；对于病毒病较重的田块可以混用10%磷酸三钠溶液浸种，一般浸30～50分钟，捞出催芽，最好在播种前以黄腐酸盐拌种。
