（1）枸杞黑果病
5—8月发病，危害青果、花蕾和花。发病后，果实出现褐色的病斑。防治措施：开沟排水，摘除病果，结果期用1：1：100波尔多液喷施，雨后立即喷50%退菌特可湿性粉剂600倍液。
（2）根腐病
6月下旬发病，7—8月较严重。初期根部发黑，逐渐腐烂，而后地上部枯萎，全株死亡。防治措施：用50%甲基托布津1000—1500倍液或50%多菌灵1000—1500倍液浇灌根部。
（3）枸杞实蝇
主要危害幼果，1年2—3代，其蛹在土内越冬。防治措施：用80%敌敌畏乳油1000倍液或40%乐果乳油1500倍液，每隔7—10天喷1次，连喷3—4次，也可人工摘除蛆果。
（4）枸杞瘿病
1年多代，4月中、下旬成虫开始产卵，而后幼虫侵入组织，使组织畸形，变成蓝黑色的痣状虫瘿，翌年新梢受危害。防治措施：发生前期，用40%乐果乳剂1500—2000倍液喷洒。 