杂交育种是通过杂交导致基因重组，产生各种各样的变异类型，为选择提供极其丰富的材料。
1. 基因重组综合双亲优良性状
由于双亲有性杂交，其后代的基因重组，可将来自不同亲本的优良基因集中到新品种中去，使新品种比其亲本具有更多的优良性状。
2. 基因互作产生新的性状
有些性状的表现是不同的显性基因互相作用或互补的结果，通过双亲染色体的交换而引起的基因重组，导致分散在不同亲本的不同显性互补基因结合起来，产生出优于双亲的性状。
3. 基因累加作用产生超亲性状
多基因控制的数量遗传性状，由于基因重组，将控制双亲同一性状的不同基因，在新品种中累加起来，产生超亲现象。
