青椒绵疫病的防治要坚持以预防为主，药剂防治为辅的策略，即要有效控制菌源，还要营造青椒适宜生长环境，发现病害时及时用药。
1、选用抗病品种，合理进行轮作。不同品种对绵疫病抗性是存在差异的，因此，要选择适合当地生产、市场需求量大的抗病性强的品种种植。为了减少土壤传播，种植青椒时应与非茄科、瓜类蔬菜实行2年以上轮作。
2、合理管控水，清除病原菌。前茬作物收获后应及时清除田间病残体，田间出现病株和病果时，及时带到田外集中烧毁或深埋，避免二次侵染。定植时不可过密，以免后期通风不良，田间荫蔽而有利于病菌传播。施用肥料时要注意氮、磷、钾肥的合理搭配，避免偏施氮肥造成植株徒长，抗病力下降。棚室栽培时应注意控制浇水，及时通风换气排湿；棚膜出现漏水的地方及时修补，防止雨水进入田间。
3、药肥兼用，补养治病相结合。田间发现病害后，即要及时地连续用药进行防治，同时，为提高植株抗病能力，可在药液中添加肥料，使病株得到营养的补充，增强抗病力，也使健株提高免疫力。
