难点1.抗病高产优质永远是育种家追求的目标，经过几十年几代育种家的努力，对金黄光皮品种三项指标的组合优化程度已经很高了，而高品质基因数量是有限的，进一步提高难度很大。好在西州蜜类型品种高品质基因的引入带来了新希望，如能成功引入这类基因，则黄皮甜瓜品种品质还可提高。
难点2.金黄光皮品种果皮深黄性状是数量性状，表现累加效应。一般来说黄皮品种果实成熟则果皮转黄，但由黄变金黄直至橘黄则很不容易。很多品种因此被淘汰。父本、母本均带有金黄皮基因产生金黄皮品种几率高。父母本一方为非黄皮品种则不可能产生金黄皮后代。
难点3.培育金黄光皮优秀品种有更多要求。
(1) 果皮要求光滑无长毛，无裂纹、不裂果（果肩和果脐）、不纵裂、果脐收缩完美。
(2) 果皮颜色要均匀一，特别是果脐周围不能有花脸，俗称“脑白金”。
(3) 果肉要厚，脆嫩酥香为佳，果肉不液化，种腔小耐储运。
(4) 果柄不能棱，完熟不脱蒂。30天左右成熟，33天上色，熟后挂秧15天不变质、不褪色、不裂果。
