嫁接作为一项高产栽培技术广泛应用于农业生产当中，其主要目的是为了根治生产上无法防控的疑难病虫害，提高接穗作物的产量及品质。嫁接育种还没有被大多数的基础研究育种者所认可，因此这项育种技术也就没有被常规的应用到育种中去。 

       传统的嫁接杂交学说认为，在嫁接植株体内砧木和接穗间能够吸收和利用对方的基因，从而发生可遗传的性状变化。近年来，人们已经证明嫁接植物砧穗间或寄生植物与其宿主间存在遗传物质的横向转运。而且砧木和接穗之间亲源关系越远，嫁接诱发的可遗传变异性越大，尤其是科间及其以上的远缘嫁接，对于一些自交不结实，杂交不亲合的抗性基因及性状基因表现优秀的野生品种而言，嫁接育种无疑是创造新种质资源的一种重要手段。 目前嫁接育种获得成功的是王成玉等应用嫁接技术和杂交方法对枸杞和辣椒进行远缘杂交，即通过先嫁接后进行有性杂交，获得了杂交种，探索培育出了新型经济作物枸杞辣椒。他们在获得嫁接杂种的同时，还在基因层面对嫁接杂种进行了更为深入的研究，系统地总结了孟德尔性状在嫁接后的遗传变异特点，发现诱导植株遗传变异的机制与高等生物的转化机制具有相似性。

       嫁接育种技术在远缘杂交技术上的应用，使杂交种的获得从不可能变成了可能，为育种工作者拓宽了育种思路，提供崭新的育种新方法。